Questo è uno studio sulla gestione dei nutrienti a lungo termine e sui sistemi di coltivazione sulla distribuzione in profondità dei bacini di carbonio organico (SOC) nel suolo, il sequestro e l'accumulo di SOC e la loro adeguatezza con la qualità del suolo per capire gli approcci di ricerca presenti e futuri. Campioni di suolo in profondità da 0 a 60 cm di profilo del suolo (a intervalli di 15 cm) sono stati raccolti dopo 13 anni di esperimenti per valutare i pool di carbonio (C) labile e recalcitrante, il carbonio organico totale, il sequestro di SOC e i tassi di accumulo. L'esperimento è stato strutturato in un disegno a strisce con gestione dei nutrienti organici al 100%, inorganici al 100% e pratiche di gestione dei nutrienti integrate in colonne e quattro sistemi di coltivazione, ovvero CS1 (riso basmati-frumento-sesbania), CS2 (mais-patata- gombo + sesbania), CS3 (riso-orzo-grammo verde) e CS4 (mais-senape-sesbania) in file. Il trattamento organico al 100% ha registrato un SOC superiore del 23,35% rispetto al trattamento inorganico al 100%, indipendentemente dai sistemi di coltivazione. L'aggiunta di un trattamento di nutrienti organici al 100% in CS3 ha mostrato il più alto accumulo di carbonio (32,0 Mg C ha−1) e il tasso di sequestro del carbonio (1,52 Mg C ha−1 anno−1). Inoltre, in termini di indice di sensibilità (SI), C solubile in acqua (WSC) e carbonio da biomassa microbica (MBC) erano altamente sensibili alle diverse pratiche di gestione dei nutrienti. Allo stesso modo, l'indice di gestione del carbonio (CMI) era nell'ordine organico > integrato > inorganico. Complessivamente, la sequenza di coltivazione del grammo di riso-orzo-verde (CS3) con pratiche di gestione dei nutrienti organici al 100% non solo ha avuto un maggiore sequestro e accumulo di C negli strati superficiali e profondi del suolo, ma ha anche migliori pool di SOC e circa il 33% in più di CMI rispetto a 100 % di trattamento inorganico nel suolo superficiale. Pertanto, l'inclusione di colture di leguminose insieme a fonti di nutrienti organici potrebbe essere considerata un sistema efficace per mantenere la futura qualità del suolo e la produttività del suolo studiato in cui predomina la coltivazione intensiva.